Una de las competencias del Pleno, es la creación de grupos de trabajo, en el marco de las Jornadas anuales de la CAU. Estos grupos, al frente de los cuales hay un coordinador, elegido por y entre sus miembros, tienen como objetivo analizar temas concretos, de actualidad y especial relevancia para los técnicos de archivo de universidades
Actualmente, existen los siguientes grupos de trabajo:
- Grupo de trabajo de identificación, valoración y clasificación de series documentales
- Grupo de trabajo de administración electrónica
- Grupo de trabajo de plan estratégico
- Grupo de trabajo para realizar una guía de archivos universitarios
- Grupo de trabajo de fondos históricos
- Grupo de trabajo de comunicación
- Grupo de trabajo de formación
- Grupo de trabajo ISO 30301
Con anterioridad, se constituyeron otros grupos de trabajo